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技术介绍 | Label free非标记定量蛋白质组学

发布时间 2022-11-15

定量蛋白质组学是利用质谱平台检测样品中蛋白相对含量的分析化学技术，非标（Label free）蛋白质组定量技术是一种不依赖于同位素标记的蛋白质定量技术，该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行分析，分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，对被检测到的离子峰强度进行积分，以积分面积进行相对定量。

应用方向

▶ 生物疾病标志物研究

▶ 生物疾病发生发展过程分子机制研究

▶ 化学或生物药物作用靶点研究

▶ 化学或生物药物作用机理信号转导研究

技术流程

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技术优势

▶ 无需标记，最大程度的保留样本的真实性

▶ 可以区分“有”“无”蛋白

▶ 不受标签数量的限制，多个样本可以同时进行蛋白定量分析

▶ 不同物种和不同的样本类型可以同时开展蛋白定量分析

▶ 处理步骤简单，成本低

技术参数

▶ 产品类型

Label free蛋白组

▶ 仪器平台

Orbitrap系列（Q Exactive HFX, Thermo/Orbitrap Exploris240, Thermo等）

▶ 搜库软件

Proteome Discoverer / MaxQuant

寄样要求

▶ 样本要求

动物及临床组织标本：100mg/sample

血清、血浆：200μL/sample

细胞、微生物：1×10⁷cells/sample

液氮或-80℃保存

足量干冰运输，避免反复冻融

案例分析

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文章标题：Epithelial Proteome Profifiling Suggests the Essential Role of Interferon-Inducible Proteins In Patients With Allergic Rhinitis

期刊：Journal of Allergy and Clinical Immunology

影响因子：10.228

技术方法：Label free非标定量蛋白组

研究内容

季节过敏性鼻炎（SAR）影响生活质量，发病相关的分子基础还不完全清楚。本文作者对29例SAR患者和31例对照组花粉季节期间和之后的受试者进行样本收集，采用Label Free蛋白组学进行了研究，通过生信分析以及WB验证，最终确定SAR患者生物标志物，健康受试者表现出跨季节的拮抗性蛋白质组反应，这可能会成为疾病预防的治疗靶点。

技术流程

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