产品介绍
空间转录组学（Spatial Transcriptomics, ST）是一类能够在保留组织原位空间位置信息的前提下，对切片内不同区域进行转录组测序的技术，通过空间条形码（spatial barcode）标记不同位点，将基因表达信息精准定位到组织的具体区域，实现 “在哪表达、表达什么” 的可视化分析。它将传统转录组的基因定量与组织形态、空间结构相结合，填补了测序数据与空间位置脱节的技术空白。
相比于普通单细胞测序只能获得细胞表达谱、丢失位置信息的问题，空间转录组的核心优势是原位解析、空间可视化，能够清晰揭示细胞在组织中的空间分布、区域化表达差异以及细胞间的微环境互作关系，有效解决了传统测序无法定位基因空间位置、难以分析组织结构异质性、无法追踪区域特异细胞亚型与疾病微环境机制等关键问题，为发育生物学、肿瘤异质性、神经解剖与疾病病理研究提供了全新的空间维度研究工具。
技术优势
◉ 保留空间位置信息：解决 “解离细胞 = 丢失空间背景” 的痛点，实现基因表达与组织微环境的原位关联分析
◉ 分辨率多样性：0.5μm，2μm，100μm，满足不同研究需求
◉ 平台多样性：10x Visium Cytassist、10x Visium HD、华大Stereo-seq，根据样品类型、分辨率与预算综合匹配
◉ 样品适配性高：适用于新鲜OCT包埋样品，也适用于FFPE、穿刺样本等临床常见样本
样本要求
组织块 | 石蜡包埋组织块、OCT包埋冰冻组织块 |
切片 | 石蜡切片（5 μm厚度），15张 |
运输说明：FFPE类样本冰袋运输、OCT类样本干冰运输
检测平台
检测平台 10x Visium Cytassist
测序平台 Illumina Novaseq Xplus、DNBSEQ-T7
应用方向
◉ 解析肿瘤异质性与微环境研究：区分肿瘤核心区、浸润区、边缘区的基因表达差异，定位癌干细胞的空间分布；识别肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞的空间互作关系，发现潜在的免疫治疗靶点。
◉ 肿瘤转移机制研究：追踪肿瘤细胞在原发灶和转移灶的基因表达变化及空间定位特征
◉ 发育生物学与神经科学：绘制不同发育阶段组织的基因表达空间图谱，明确细胞分化的空间轨迹
◉ 病理诊断与精准医学：结合形态学和基因表达特征，实现肿瘤的精准分型；发现具有空间特异性的生物标志物，提升疾病诊断的灵敏度和特异性。
◉ 植物科学研究：解析根、茎、叶等器官不同区域的基因表达模式，研究细胞分化和器官建成机制；定位植物在干旱、病虫害等胁迫下，基因表达变化的空间特异性区域，揭示抗逆机制。
◉ 微生物组与宿主互作：分析微生物在宿主组织表面的空间分布及基因表达，明确微生物与宿主细胞的互作靶点，例如肠道菌群与肠黏膜细胞的共生机制。
案例应用
1.High-definition spatial transcriptomic profiling of immune cell populations in colorectal cancer.2025.Nature Genetics【IF=41.3】
2.Bin2cell reconstructs cells from high resolution Visium HD data.2024.Bioinformatic【IF=6.3】
3.Spatiotemporal transcriptome atlas of human embryos after gastrulation.2026.Nature【IF=69.5】
空间转录组学综合解决方案，数据分析软件，质谱检测技术及介绍，全面的联用技术等。
