产品介绍
“单细胞级别”的空间蛋白质组学，技术的核心在于使用高精度激光捕获显微切割技术（LCM）来切取感兴趣的组织区域或细胞，然后通过优化的超微量样本无损提取并酶切蛋白为肽段，最后利用高灵敏度质谱分析不同空间位置上的蛋白表达情况，对组织区域或特定细胞类型的精确识别，为研究细胞空间异质性、揭示细胞微环境的复杂性提供了强有力的工具，有助于大家理解疾病机制和发现新的生物标志物。
技术优势
◉ 超高空间精度：切割区域可精确到单细胞，极致保留空间异质性，精准捕捉单细胞水平蛋白表达差异
◉ 精准特异：LCM 精准分离目标区域，结合 LC-MS 减少干扰，结果精准可靠
◉ 高敏低限：可检测低丰度蛋白，适配微量 / 疾病早期样本，助力标志物发现
◉ 空间 - 定量融合：兼具空间分辨率与精确定量能力，解析组织异质性
◉ 兼容扩展：可联动多组学及生物信息学工具，挖掘深层生物学信息
◉ 样本适用广：适配 FFPE、冰冻切片等多种样本类型
样本要求
◉ 组织块：FFPE组织块、OCT包埋冰冻组织块
◉ 切片：FFPE切片、OCT切片（冰冻切片）
◉ FFPE类样本冰袋运输、OCT类样本干冰运输
检测平台
timsTOF Pro2, Bruker
应用方向
◉ 肿瘤研究：解析肿瘤微环境细胞互作与信号通路，研究肿瘤异质性以指导个体化治疗，探索肿瘤发生发展机制并发现早期标志物
◉ 疾病诊断与预后：发现疾病特异性标志物，实现疾病精细分型与预后判断，助力精准治疗
◉ 组织器官图谱构建：绘制正常/疾病组织空间蛋白质组图谱，揭示组织生理功能与病理分子特征
◉ 药物研发与靶点发现：阐明药物作用机制，预测疗效并解析耐药机制，优化药物设计与联合用药方案
◉ 细胞与发育生物学：研究细胞器功能与细胞信号传导机制，追踪胚胎发育蛋白表达变化，揭示细胞分化与器官形成规律
◉ 感染与免疫研究：解析病原体感染与免疫逃逸机制，研究免疫细胞活化与调控规律，助力抗感染药物与免疫治疗研发
案例应用
英文标题：Clinical functional proteomics of intercellular signalling in pancreatic cancer
发表期刊：Nature
影响因子：48.5
技术方法：空间蛋白质组学
研究内容：该研究开发了多维度临床功能蛋白质组学策略 TMEPro，对 100 例人胰腺组织样本的分泌与膜蛋白开展深度、空间、时间、酪氨酸磷酸化及膜蛋白胞外区脱落分析，系统解析胰腺癌肿瘤微环境（TME）中癌细胞与基质细胞的细胞间信号网络，构建 1600 余种关键信号轴；揭示基质 PDGFR - PTPN11 - FOS 信号轴介导的双向细胞互作环路，发现基质金属蛋白酶介导的 AXL 受体胞外域脱落可调控细胞间信号，且 AXL 脱落水平与淋巴结转移相关，联合抑制 AXL 脱落与激酶活性能协同抑制癌细胞生长，为胰腺癌诊疗提供新靶点与标志物线索。
Fig.基于空间蛋白质组学进行特异性蛋白质组分析
英文标题：Deep spatial proteomics reveals region-specific features of severe COVID-19-related pulmonary injury
发表期刊：Cell Reports
影响因子：6.9
技术方法：空间蛋白质组学
研究内容：COVID-19（由SARS-CoV-2引起）对公共卫生构成严重的威胁，尽管已经有疫苗和靶向药物的开发，但对重症病例的治疗方案仍然不足。本研究旨在深入探究新冠肺炎导致肺部损伤的蛋白质基础，并通过高分辨率的空间蛋白组学方法揭示其分子机制。研究人员结合激光显微切割成像技术和超高灵敏度蛋白质组学技术，对COVID-19患者的肺部组织中的三个基本结构（即肺泡上皮（AE）、支气管上皮（BE）和血管（VE））以及四个病理改变区域（支气管粘液栓（BMP）、肺部纤维化（PF）、肺泡内炎性细胞浸润（ASI）和增生性ll型肺泡细胞（HAT2））进行了分析，并鉴定出超过10,000种蛋白质，同时与非COVID-19对照组进行比较分析，揭示了COVID-19患者肺部组织中存在的多种蛋白质表达水平变化和功能异常，为COVID-19的治疗提供了重要的参考依据。
Fig.本研究机制图解
空间蛋白质组学综合解决方案，数据分析软件，质谱检测技术及介绍，全面的联用技术等。
