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泛素化修饰DIA定量蛋白质组学

产品介绍

蛋白质泛素化(Ubiquitination)是蛋白质在一系列特殊酶的作用下,被泛素(ubiquitin, 76个氨基酸组成的多肽)共价修饰的过程,泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物80%~90%蛋白质的降解,在几乎所有的真核细胞活动中起着关键作用,是一种重要的翻译后修饰。




技术优势

◉  单份样本可同时进行泛素化修饰蛋白组学+其余修饰,一站式服务

  价格便宜且保证发文位点检出量

  经验丰富的蛋白质修饰组研究团队

  真实,可靠,严谨的数据分析

  售后服务更完善,提供技术1对1服务

◉  高分辨率、高灵敏度质谱仪




样本要求

细胞、微生物

5×10^7 cells/sample

动物及临床组织标本

100 mg/sample

植物嫩叶、嫩芽

8 g/sample

植物种子、果实

16 g/sample

液氮或-80°C保存

足量干冰运输,避免反复冻融





检测平台


磷酸化修饰DIA定量蛋白质组学(图1)

Orbitrap Astral Zoom, Thermo




应用方向

◉  泛素-蛋白酶体降解通路参与的各类生理过程研究

◉  泛素-蛋白酶体降解通路调控异常引起疾病的发生等研究




案例应用

◉  医学方向

英文标题:Integrative proteomics reveals an increase in non-degradative ubiquitylation in activated CD4+ T cells

发表期刊:Nat Immunol

影响因子:23.53

技术方法:泛素化修饰定量蛋白组、蛋白组、转录组

研究内容:越来越多的证据表明泛素化可以直接导致非降解性的结果,但大多数关于T细胞泛素化的研究都集中在降解上。本文作者通过整合小鼠原代CD4+T细胞的蛋白质组和转录组数据,建立一个框架来预测泛素化引起的降解性或非降解性结果。二甘氨酸残基分析用于揭示泛素化的蛋白质,结合全细胞蛋白质组和转录组数据可以预测蛋白质的降解。通过二甘氨酸残基法鉴定泛素化蛋白的分析表明,CD4+T细胞的激活导致非降解性泛素化的增加。这与非蛋白酶体靶向的K29、K33和K63多泛素链的增加有关。本项研究揭示了1,200多种蛋白质在小鼠原代CD4+T细胞中泛素化,并强调了非蛋白酶体靶向泛素链在T细胞信号转导中的相关性。

技术路线:


泛素化修饰DIA定量蛋白质组学(图2)


实验结果:


泛素化修饰DIA定量蛋白质组学(图3)


◉  农学方向

英文标题:Central Role of Ubiquitination in Wheat Response to CWMV Infection

发表期刊:Viruses 

影响因子:5.818

技术方法:泛素化修饰蛋白质组学

研究内容:泛素化是一种重要的翻译后修饰(Post‐translationmodification, PTM)类型,几乎参与了所有真核生物的生物学过程,在植物对病原体侵染的反应中起着至关重要的作用。然而,迄今为止,很少有大规模分析病原体(特别是病毒)诱导的小麦泛素化修饰的实例。该研究结合质谱分析鉴定了参与CWMV感染的泛素化蛋白,利用生物信息学进一步分析了这些泛素化蛋白的潜在生物学功能。

在感染CWMV的小麦植株中,共鉴定出1255个泛素化蛋白,2297个赖氨酸泛素化位点,其中192个蛋白质中350个赖氨酸泛素化位点存在表达差异。这些差异蛋白质在胁迫和激素、植物-病原体相互作用等代谢途径中进一步富集。此外,在CWMV感染过程中,先天性免疫系统的关键Ta14-3-3和TaHSP90显著增强,表明泛素化修饰在CWMV感染的调控网络中起着至关重要的作用。

技术路线:


泛素化修饰DIA定量蛋白质组学(图4)


研究成果:


泛素化修饰DIA定量蛋白质组学(图5)

 




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