真核有参转录组是针对真核生物(如人类、动物、植物、真菌等),利用该物种已有的参考基因组序列,对其mRNA进行研究的技术手段。通过高通量测序获取细胞或组织在特定状态下的所有转录本信息,同时结合参考基因组和注释文件进行序列比对、注释等分析,从而揭示基因表达模式、转录本结构变异等生物学信息。
技术优势
1、准确性高:依赖已知的参考基因组,序列比对和基因注释更可靠,减少假阳性结果。
2、通量高:在较短的时间内,可以产生数以百万计的基因表达数据
3、稳定性:可提供准确的基因表达定量信息,使得不同实验之间的比较更具有可靠性和重复性
4、全面性:不仅能够揭示所有外显子区域的信息,还可以检测到潜在的新基因、新转录本和剪接异构体等
应用方向
1、基础研究:探索基因在不同组织、发育阶段或生理状态下的表达规律,解析生物学过程的分子机制。
2、疾病研究:寻找疾病相关的差异表达基因、生物标志物,揭示疾病发生、发展的分子基础。
3、农业研究:分析作物或畜禽在逆境(如干旱、病虫害)下的基因表达变化,筛选与抗逆、品质相关的候选基因,用于育种改良。
4、药物研发:研究药物处理后细胞的转录组变化,鉴定药物靶点或评估药物疗效。
合作案例
1. Liquid crystal monomers induce placental development and progesterone release dysregulation through transplacental transportation.2025.Nature Communication【IF=14.7】
2. Sustained therapeutic effects of self-assembled hyaluronic acid nanoparticles loaded with α-Ketoglutarate in various osteoarthritis stages.2025.Biomaterials【IF=12.8】
3. Hippo pathway activation mediates chemotherapyinduced anti-cancer effect and cardiomyopathy through causing mitochondrial damage and dysfunction.2023.Theranostics.(IF=11.6)【客户文章】
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