产品介绍
单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术，能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题，有助于发现新的稀有细胞类型，深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。利用微流控系统、油包水的微反应体系，通过序列标签（barcode和UMI）区别群体中的不同细胞和转录本，获得单细胞水平的基因表达谱，实现数千甚至上万个单细胞群体分析。
技术优势
◉ 高通量：一次可以检测8个样本，每个样本检测上万个细胞
◉ 周期短：15分钟内完成单细胞捕获，一天之内可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库
◉ 捕获效率高：细胞捕获效率高达65%
◉ 样品普适性高：适用于多种样品类型，根据关注的不同细胞类型，可选择新鲜组织制备细胞悬液或者冻存组织抽取细胞核
样本要求
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样品类型 |
送样建议（供参考） |
时效性 |
运输保存条件 |
注意事项 |
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人全血 |
4ml |
12h |
4℃，EDTA-K2抗凝管 |
只能使用EDTK-K2抗凝管采集血液样本 |
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小鼠全血 |
1-2ml |
12h |
4℃，EDTA-K2抗凝管 |
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新鲜组织 |
＞200mg |
48h |
4℃，组织保存液 |
血管，软骨，胰腺和穿刺样本提前咨询实验室 |
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细胞悬液 |
＞50万 cells |
4h |
4℃，培养基/含2-10%FBS培养基 |
尽快送至实验室 |
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体液 |
＞10ml |
4h |
4℃ |
尽快送至实验室，一、原液寄送，二、混合培养基寄送，三、离心后用培养基重悬寄送 |
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类器官 |
＞200mg |
48h |
4℃，培养基或组织保存液 |
尽快送至实验室 |
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冻存细胞 |
＞50万 cells |
/ |
-80℃，细胞冻存液 |
建议干冰15-20kg |
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冻存组织 |
＞100mg |
/ |
-80℃ |
建议干冰15-20kg |
检测平台
10x Genomics Chromium iX、DNBelab C-TaiM4
应用方向
◉ 肿瘤方向：解析肿瘤微环境中癌细胞、免疫细胞、基质细胞的异质性特征，识别肿瘤干细胞、循环肿瘤细胞等关键亚群，揭示肿瘤发生、转移及耐药的分子机制
◉ 发育生物学：追踪胚胎发育、器官形成过程中细胞的分化轨迹，鉴定细胞命运决定的关键调控基因，构建细胞分化的动态分子图谱，阐明发育的时空调控规律
◉ 免疫机制：刻画免疫细胞（如 T 细胞、B 细胞、巨噬细胞）的亚型多样性与功能状态，解析免疫细胞在感染、自身免疫病、肿瘤免疫中的应答机制与细胞间通讯网络
◉ 神经科学：鉴定大脑及神经系统中多样化的神经元与胶质细胞亚型，揭示不同细胞亚群在神经信号传递、神经退行性疾病发生发展中的作用
◉ 药物研发：基于患者单细胞转录组数据进行疾病分型，筛选特异性分子标志物用于疾病早诊与预后评估，为靶向治疗药物研发提供精准的细胞靶点与作用机制依据。
案例应用
1. Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report. 2020. Nature medicine.【IF=87.24】
2. A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer.2021.Nature Medicine【IF=87.24】
3. Molecular architecture of the developing mouse brain.2021.Nature【IF=69.5】
单细胞转录组学综合解决方案，数据分析软件，质谱检测技术及介绍，全面的联用技术等。
