宏基因组

产品介绍

宏基因组(Metagenomics),也称元基因组,利用新一代高通量测序技术(Next Generation Sequencingtechnology, NGS)以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上,可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。与传统微生物研究方法相比,宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。




技术优势

◉  通量高,拥有标准化实验室和高通量测序平台,数据库可靠

◉  可检测不可培养物种,可检测痕量微生物

◉  针对样品来源不同,提供不同的功能数据库注释




样本要求

土壤/淤泥/沉积物等

≥5 g

空气滤膜(0.22-0.45μm)

≥5张

粪便

≥1 g

小鼠粪便

5粒

肠道内容物/肠组织/肠粘膜

≥2 g

拭子类

≥5个

植物组织

≥3 g

唾液/痰液

≥5 ml

瘤胃液/发酵液

15ml瘤胃液离心得到的沉淀

酒醅酒糟

≥5 g





检测平台


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Illumina NovaSeq Xplus、DNBSEQ-T7




应用方向

◉  环境生态与污染修复:解析各类生境微生物群落结构,挖掘降解污染物的功能菌株与基因,用于土壤、水体污染治理

◉  临床医学与病原诊断:快速检测临床样本中的病原体,同时研究人体微生物组与疾病的关联机制

◉  农业科学与绿色种植:开发植物促生菌、生物农药,解析土壤微生物与作物生长的关系,助力生态农业发展

◉  工业生物技术与资源开发:筛选特殊功能酶与高价值代谢产物合成基因,应用于工业催化、生物制药等领域

◉  食品科学与安全:测发酵食品微生物群落以优化工艺,快速检测食源性致病菌,保障食品质量安全




案例应用

1. Alterations of gut virome with close interaction in the progression of estrogen deficiency-induced osteoporosis.2024.GUT MICROBES【IF=12.20】  

2. Aging microplastics and coupling of “microplastic-electric fields” can affect soil water-stable aggregates’ stability.2024.Journal of Hazardous Materials 【IF=13.60】




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