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单细胞蛋白组学

产品介绍

单细胞蛋白质组学(Single-Cell Proteomics,SCP)是在单个细胞层面对蛋白质进行高通量定性与定量分析的前沿方法,通过超高灵敏度质谱或基于抗体的标签标记,直接读取单个细胞内的蛋白表达谱,从蛋白水平揭示细胞的真实功能状态。它突破了传统蛋白质组只能分析大量细胞、无法反映细胞间差异的局限,实现了从基因到蛋白层面的单细胞分辨率解析。该技术的核心优势在于直接反映细胞功能表型,能够精准捕捉细胞异质性、区分功能亚群,并检测转录后修饰与蛋白丰度变化,有效解决了转录水平与蛋白水平表达不完全对应、稀有细胞功能难以表征、肿瘤耐药及免疫细胞活化机制无法精细解析等关键问题,为发育、肿瘤、免疫及精准医学研究提供了最贴近细胞表型的研究手段。




技术优势

◉  精准解析细胞异质性,避免群体平均偏差:可直接测量单个细胞的蛋白谱,精准区分细胞亚群、稀有细胞及过渡态细胞;

  直接反映蛋白功能:单细胞水平mRNA与蛋白表达相关性仅约0.2,蛋白组数据更贴近细胞真实功能状态;捕获翻译后修饰(PTM)如磷酸化、乙酰化;

  超高灵敏度与微量样本适配性:依托全自动单细胞分离与纳升级分配(CellONE)、高分辨质谱(如Orbitrap Astral、Orbitrap Astral Zoom)等技术,检测单个细胞内纳克级别总蛋白中的上千种蛋白,适合临床穿刺样本、胚胎细胞、干细胞等珍贵/微量样本分析,降低样本损耗与实验成本;

◉  高分辨率定性定量:依托DIA-PASEF技术实现高分辨率定性定量分析;精准解析细胞周期、应激反应等依赖性分子事件的动态变化。




样本要求

样本类型

样本量

时效性

运输保存条件

注意事项

血液

1 mL

12h

4℃,EDTA-K2抗凝管

只能使用EDTK-K2抗凝管采集血液样本

新鲜组织

>50 mg

48h

4℃,组织保存液

血管,软骨,胰腺和穿刺样本送样量请提前咨询实验室

细胞悬液

>10万 cells

4h

4℃,培养基/含2-10%FBS培养基

尽快送至实验室

冻存细胞

>10万 cells

/

-80℃,细胞冻存液

建议干冰15-20kg





检测平台


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Orbitrap Astral, Thermo




应用方向

◉  细胞异质性与亚群鉴定:解析同类型细胞的蛋白表达差异,发现稀有功能细胞亚群(如肿瘤干细胞、特殊免疫细胞),明确细胞分型的蛋白标志物

  发育与细胞命运调控:追踪细胞分化、胚胎发育等过程的蛋白动态变化,揭示细胞命运决定的分子调控网络,解析过渡态细胞的蛋白表达特征

◉  疾病机制与标志物发现:在肿瘤、神经退行性疾病等疾病研究中,定位病变单细胞的蛋白异常表达或修饰,筛选疾病早期诊断、预后评估的蛋白标志物,解析耐药、病变的分子机制

◉  微环境与细胞间互作研究:结合空间技术,分析组织原位单细胞的蛋白分布与表达,揭示细胞间信号传导、微环境对细胞功能的调控作用(如肿瘤微环境、免疫微环境)




案例应用

【1】Enhanced sensitivity and scalability with a Chip-Tip vworkflow enables deep single-cell proteomics. 2025.nature methods【IF=32.1】




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