产品介绍
全转录组是指特定组织或细胞在某一功能状态下转录产生的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。与常规转录组测序相比，全转录组测序通过去除rRNA进行的建库和测序，可以同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA信息，并对其进行联合分析ceRNA分析，解析 RNA 分子间通过竞争结合 microRNA（miRNA）而形成的调控网络，为理解基因表达调控的复杂性提供了新视角。它将 mRNA、lncRNA、circRNA 等不同类型的 RNA 整合到统一的调控网络中，是当前非编码 RNA 功能研究和疾病机制探索的重要手段，尤其在精准医学和靶向治疗领域具有广阔应用前景。
1.两文库全转录组测序：LncRNA+miRNA
（1）采用去核糖体链特异性建库方式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析；
（2）采用富集小RNA片段建库方法，进行PE150测序，实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量，以及功能分析等；
2.三文库全转录组测序：LncRNA+miRNA+ CircRNA
（1）采用去核糖体链特异性建库模式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析；
（2）采用去除线性RNA，富集环状RNA建库方法，进行PE150测序，实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析；
（3）采用富集小RNA片段建库方法，进行PE150测序，实现miRNA的鉴定和定量，以及功能分析等；
以上两种模式，还可以实现互作网络分析，以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。
技术优势
◉ 全面性：同时检测多种RNA类型，避免单一RNA 测序的局限性，能更系统地解析转录调控机制
◉ 高分辨率：可检测低丰度 RNA、可变剪接、RNA编辑等细微变化
◉ 高通量：一次实验可获得海量数据，适合大规模样本分析
◉ 互作网络构建：预测 lncRNA-miRNA、circRNA-miRNA、miRNA-mRNA 等相互作用，构建调控网络
◉ 适用物种条件：动物、植物，同时需要有参考基因组和完整注释文件
样本要求
动物组织 | 实质脏器组织≥200 mg（脂肪、皮肤、骨头等RNA含量较低组织≥2 g） |
植物组织 | 嫩叶根茎花果实≥500 mg |
动物细胞 | ≥10⁷个 |
人全血PAXgene采血管 | ≥2管，按照PAXgene采血管使用说明操作即可 |
真菌菌体/菌丝 | ≥2*10⁷个/500mg |
全血trizol法 | 新鲜采集≥5 ml |
RNA | 总量≥5 μg |
检测平台
Illumina NovaSeq X Plus
应用方向
◉ 基础研究：解析基因表达调控网络、细胞分化与发育机制、非编码 RNA 的功能等
◉ 疾病研究：寻找疾病相关的 RNA 标志物（如癌症、神经退行性疾病），探索疾病发生发展的分子机制
◉ 药物研发：筛选药物靶点，评估药物对转录组的影响，优化药物疗效
◉ 农业领域：研究作物抗逆性、品质相关基因的表达调控，助力品种改良
案例应用
1. LncRNA H19/miR-675 axis drives metabolic reprogramming and therapeutic resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma.2023.Nature Communications【IF=17.69】
2. LncRNA MIR155HG/miR-155-5p axis shapes tumor immune microenvironment by regulating PD-L1 expression in triple-negative breast cancer.2022.Advanced Science【IF=25.476】
3. Deep annotation of long noncoding RNAs by assembling RNA-seq and small RNA-seq data.2021.Nucleic Acids Research【IF=19.16】
全转录组测序综合解决方案，数据分析软件，质谱检测技术及介绍，全面的联用技术等。
