全转录组是指特定组织或细胞在某一功能状态下转录产生的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。与常规转录组测序相比，全转录组测序通过去除rRNA进行的建库和测序，可以同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA信息，并对其进行联合分析ceRNA分析，解析 RNA 分子间通过竞争结合 microRNA（miRNA）而形成的调控网络，为理解基因表达调控的复杂性提供了新视角。它将 mRNA、lncRNA、circRNA 等不同类型的 RNA 整合到统一的调控网络中，是当前非编码 RNA 功能研究和疾病机制探索的重要手段，尤其在精准医学和靶向治疗领域具有广阔应用前景。
1.两文库全转录组测序：LncRNA+Small RNA
（1）采用去核糖体链特异性建库方式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析；
（2）采用富集小RNA片段建库方法，进行PE150测序，实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量，以及功能分析等；
2.三文库全转录组测序：LncRNA+ Small RNA+ CircRNA
（1）采用去核糖体链特异性建库模式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析；
（2）采用去除线性RNA，富集环状RNA建库方法，进行PE150测序，实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析；
（3）采用富集小RNA片段建库方法，进行PE150测序，实现miRNA的鉴定和定量，以及功能分析等；
以上两种模式，还可以实现互作网络分析，以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。
技术优势
1、全面性：同时检测多种RNA类型，避免单一RNA 测序的局限性，能更系统地解析转录调控机制。
2、高分辨率：可检测低丰度 RNA、可变剪接、RNA编辑等细微变化。
3、高通量：一次实验可获得海量数据，适合大规模样本分析。
4、互作网络构建：预测 lncRNA-miRNA、circRNA-miRNA、miRNA-mRNA 等相互作用，构建调控网络
5、适用物种条件：动物、植物，同时需要有参考基因组和完整注释文件
应用方向 1、基础研究：解析基因表达调控网络、细胞分化与发育机制、非编码 RNA 的功能等。 2、疾病研究：寻找疾病相关的 RNA 标志物（如癌症、神经退行性疾病），探索疾病发生发展的分子机制。 3、药物研发：筛选药物靶点，评估药物对转录组的影响，优化药物疗效。 4、农业领域：研究作物抗逆性、品质相关基因的表达调控，助力品种改良。 转录组学综合解决方案，数据分析软件，测序检测技术及介绍，全面的联用技术等。
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