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PRM靶向蛋白质组学

产品介绍

平行反应监测(parallel Reaction Monitoring, PRM)是一种与MRM技术类似的靶向检测方法,两者不同之处在于PRM使用高分辨的质谱仪(Q Orbitrap/Q TOF),能显著降低背景杂质干扰,提高检测的选择性和特异性。能够对目标蛋白质、目标肽段(或发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行相对(绝对)定量。PRM技术基于Orbitrap为代表的高分辨、高精度质谱平台,首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在collision cell 中对母离子进行碎裂,最后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析,可实现相对定量(目的同WB)/绝对定量(目的同Elisa)分析。




技术优势

◉  超高灵敏度:可检测阿托摩尔级痕量分子,适配复杂生物样本低丰度分析

  高特异性:精准排除背景干扰,减少假阳性

  宽动态范围:4-6 个数量级线性定量,覆盖高低浓度分子

  定性定量一体:二级谱图支持结构验证,同步完成定量

  无抗体依赖:规避抗体相关问题,适配稀缺抗体 / 特殊物种蛋白

◉  高通量高效:单次可定量数十至上百个目标,降本提效

◉  高可靠可重复:标准化流程保障结果准确,适配大规模研究

◉  广样本兼容:适用于各类生物样本,流程简单




样本要求

动物组织标本

50 mg/sample

血清、血浆

100 μL/sample

细胞、微生物

1×10^7 cells/sample

液氮或-80°C保存

足量干冰运输,避免反复冻融





检测平台


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Tims TOF Pro2, Bruker




应用方向

◉  验证修饰和非修饰定量蛋白组学结果

◉  目标蛋白/肽段相对定量和绝对定量分析




案例应用

◉  医学方向

英文标题:Identification of a Blood-Based Protein Biomarker Panel for Lung Cancer Detection

发表期刊:Cancers

影响因子:6.126

技术方法:PRM 技术

研究内容:肺癌是世界上最致命的癌症,主要是由于它在诊断时处于晚期。非侵入性的早期检测方法仍然是提高患者生存率的必要手段。本文采用液相色谱-平行反应监测(LC-PRM)质谱法测定128例肺癌患者和93例健康献血者血浆中351种蛋白质的水平,通过生信分析寻找最佳蛋白组合用于预测。确定了血浆中6个蛋白质作为肺癌的潜在诊断工具,并在48名患者和49名健康志愿者中得到验证。作为高风险和中等风险人群的常规检查,它可以补充目前在肺癌筛查中采用的技术。


PRM靶向蛋白质组学(图2)


◉  农学方向

英文标题:Divergent responses of Atlantic coastal and oceanic Synechococcus to iron limitation

发表期刊:Proc Natl Acad Sci U S A

影响因子:9.412

技术方法:Label free蛋白质、PRM靶向蛋白组

研究内容:海洋聚球藻是种类最丰富、分布最广的浮游植物之一,而铁(Fe)是一种重要的微量营养素,限制了海洋许多地区的生产力。为了研究沿海和海洋大西洋聚球藻菌株如何适应铁的有效性,我们比较了来自不同铁环境的两个聚球藻菌株的生长、光生理学和定量蛋白质组学。聚球藻菌株WH8102来自马尾藻海南部的一个区域,该区域有大量的灰尘沉积,随着铁含量的下降,其生长和光生理学表现出受损,但很少使用驯化反应。来自动态、季节性变化的新英格兰大陆架的沿海WH8020显示了具有不同铁阈值的多层次、分级的适应反应级联。多层次的反应包括铁的获取、储存和光合蛋白质的变化,黄氧毒素替代铁氧还蛋白,以及改良的光生理学,同时在一定范围内保持显著稳定的生长速率。

技术路线:


PRM靶向蛋白质组学(图3)


研究成果:


PRM靶向蛋白质组学(图4)




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