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新一代代谢组学NGM 2

产品介绍

新一代代谢组学NGM解决了代谢组学中物质鉴定不准确、鉴定数量少的问题,是代谢组学核心研究手段之一,可高效完成样本中代谢物的检测定性,即通过液质联用(Liquid Chromatograph-Mass Spectrometer, LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。

尤为值得关注的是,NGM 2搭载了朱正江老师实验室的专利算法MetDNA 3。该算法打破对标准谱图库的依赖,基于代谢反应网络实现无标代谢物的大规模注释,显著提高鉴定效率与准确度。此外,MetDNA 3具备极强的普适性,可适配多物种、多样本类型及多种仪器平台,在科研与临床应用场景中均能稳定输出可靠结果,为代谢组学研究挖掘生物标志物、解析生物学机制提供核心技术支撑。




技术优势

◉  可靠代谢物总体鉴定数量1500+

  准确鉴定代谢物数量近10倍提升,高达500+ Level 1代谢物

  队列间稳定检出物质高达60%(Level 1)

  代谢物鉴定准确率翻倍提升,高达98.5% (Level 1)

  严格的7D质控




样本要求

血清、血浆

200 μL/sample

尿液

200 μL/sample

组织

200 mg/sample

粪便、肠道内容物

200 mg/sample

细胞、微生物

1×10 cells/sample

培养液

200 μL/sample





检测平台


新一代代谢组学NGM 2(图1)

Orbitrap Exploris 120, Thermo




应用方向

◉  临床疾病:生物标志物寻找、治疗疗效监控、疾病分型

◉  食品:加工工业开发、产业溯源/真伪鉴别、营养学

◉  畜牧:科学饲养、疾病防治、发育研究

◉  药物:药物研发、药代动力学

◉  中医药:治疗机理、质量控制、毒副作用评价

◉  环境毒理:暴露组学




案例应用

英文标题:Knowledge and data-driven two-layer networking for accurate metabolite annotation in untargeted metabolomics

中文标题:知识与数据双层网络驱动的非靶标代谢组精准注释

发表期刊:nature communications

影响因子:15.7

研究背景:基于液相色谱-质谱(LC-MS)的非靶标代谢组学可以检测样本中已知和未知的代谢物。然而,未知代谢物的注释仍是非靶标代谢组学的主要挑战。

研究结果:在MetDNA3中,作者开发了一种两层交互式网络拓扑结构来增强代谢物注释 。通过跨网络互动实现了递归式的代谢物注释,显著提高了物质注释的效率、覆盖度和准确性,为代谢组学研究及相关生命科学与医学应用提供了有力的技术支撑。

结果展示:在多种生物样本的代谢组学数据集测试中,MetDNA3成功注释到1600+Level 1的代谢物,并通过基于网络拓扑技术注释了超12,000种代谢物。在此基础上,通过双网络驱动的传播式迭代注释,还发现并验证了两种未收录于人类代谢组数据库的新代谢物。研究同时表明,高特异性的知识网络对于提高网络注释的准确性和传播效果至关重要。


新一代代谢组学 NGM 3(图1)

 Fig. 提升代谢物注释的覆盖度和正确率




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      新一代代谢组学NGM 2综合解决方案,数据分析软件,质谱检测技术及介绍,全面的联用技术等。


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