
从 “看合影” 到 “读个体”:单细胞代谢组学捕捉细胞实时生命信号
过去,我们观测细胞如同 “看合影”,只能得到群体平均值,却忽略了细胞间的真实差异--细胞异质性。从单细胞测序、单细胞转录组到单细胞蛋白质组,技术不断突破,终于实现对单个细胞的精准解析。而单细胞代谢组学,正是这一技术浪潮的新高峰,直接捕捉细胞最实时的生命状态。
细胞是生命的基本单元,而代谢物是细胞功能的最终执行者,氨基酸、糖类、脂质、核苷酸等小分子代谢物,直接反映细胞的活跃状态、应激反应与病变特征。与基因、蛋白相比,代谢物变化更快速、灵敏、真实,是细胞的实时生命信号。传统代谢组学只能检测一群细胞的平均值,无法分辨每个细胞的独特性,而单细胞代谢组学能在单个细胞尺度,定性定量检测数百至数千种代谢物,还原每个细胞的独特代谢指纹。
技术突破:离子迁移质谱流式技术
长期以来单细胞代谢组学面临巨大挑战:代谢物含量极低(通常只有阿摩尔水平)、检测灵敏度不足、代谢物覆盖范围有限、注释准确性低等问题,严重限制了这一领域的发展。百趣生物首席科学家朱正江研究员及其团队开发的这项融合了流式细胞术和离子迁移率-质谱联用的新技术,依托超高灵敏度质谱、流式细胞术、离子淌度分离等技术,实现了对单个细胞内微量代谢物的稳定捕获与高效分离,突破了传统方法“灵敏度不足、覆盖度低、注释准确性低”等瓶颈,让单细胞代谢物检测从“不可能” 变为 “常规化”,这一技术创新的核心主要体现在两个方面:
01 离子迁移率选择性离子积累
通过调整离子迁移率参数,实现了对低质量代谢物的选择性富集:低质量离子(m/z<400 Da)的相对百分比提高了4倍,极低质量离子(m/z<200 Da)更是提升了12倍,这意味着能够更有效地检测到那些原本难以被发现的代谢物。

02 细胞叠加提升检测稳定性
将数百个细胞的数据叠加,大幅提高信噪比。通过叠加600个细胞的数据,乙酰肉碱的信噪比提升了近50倍,这种策略将代谢物检测的丢失率从82%降低到了6%,大大提高了数据的完整性和可靠性。

核心优势,铸就行业标杆性能
百趣生物MetCell™单细胞代谢组学技术的性能表现引领行业:
活细胞:真正意义上实现活细胞层面代谢物的检测
高通量:25-40个细胞/分钟的检测速度,轻松实现数万细胞的代谢检测,为大规模研究提供了可能。
高灵敏:阿摩尔(10-18mol)级别的检测极限,能够检测到单个细胞中含量极低的代谢物。
深覆盖:单个细胞中检出5000+代谢物,注释1000+物质,远高于已有方法的检出和注释水平。
准注释:通过整合MS1、MS2、碰撞截面积(CCS)三维匹配策略,系统性解决信号弱、同分异构体难区分、注释置信度不足等问题。
专属分析引擎:MetCell
MetCell专门用于离子淌度质谱流式单细胞代谢组学的一站式数据分析软件,不是普通的 “元细胞(metacell)” 聚类工具,而是针对单细胞质谱流(mass cytometry)代谢数据的高覆盖、自动化分析平台,包括单细胞帧检测、细胞叠加、峰检测、峰定量和代谢物注释等功能,形成了完整的数据分析流程,打通从原始质谱数据 → 单细胞代谢谱 → 细胞亚群 → 功能通路 → 疾病机制的全链条,实现大规模单细胞事件与高维代谢特征的快速解析、深度挖掘与可视化展示,为高通量、大队列的单细胞代谢研究提供了强有力的分析支撑。
开启单细胞代谢组学新纪元,赋能精准医学未来
这项技术突破为单细胞代谢组学研究树立了新的标杆。它不仅解决了长期以来困扰该领域的技术难题,还为生物医学研究开辟了新的可能性。从疾病机理研究到药物开发,从衰老研究到精准医疗,这项技术都有广阔的应用前景。
随着技术的进一步完善和普及,我们有望更深入地理解细胞水平的代谢异质性,为疾病诊断和治疗提供更加精准的依据。单细胞代谢组学的春天已经到来,而这只是开始。

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