文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制
发布时间 2023-08-08

640 (5).png

文章标题:Defects in the Proteome and Metabolome in Human Hypertrophic Cardiomyopathy

发表期刊:Circulation-Heart Failure

影响因子:9.7

组学平台:Label free定量蛋白质组学+代谢组学



研究背景


肥厚型心肌病(HypertrophicCardiomyopathy, HCM)是一种以心肌肥厚为特征的原发性心肌疾病,每500人中就有1人受到影响,是导致心力衰竭和猝死的主要原因。很多研究者付出了巨大的努力来探究HCM的病理机制,并通过细胞和动物模型对疾病发病机制产生了非常有价值的见解,但这些模型并不能概括人类HCM的特征。有研究表明能量代谢与HCM有关,但参与HCM疾病发生和进展的关键机制尚不清晰。本研究对接受间隔肌切除术的HCM患者的心脏样本进行了配对Label free定量蛋白质组学和靶向代谢组学分析,以确定人类HCM代谢重编程的性质和程度,及其对收缩功能的潜在影响。



技术路线


640 (6).png



研究结果


01
蛋白质组学分析揭示了HCM中参与收缩性、细胞外基质和能量代谢的蛋白质存在显著差异

对接受间隔肌切除术的HCM患者的心脏样本进行了配对Label free定量蛋白质组学分析,共鉴定出509种蛋白质。经多重比较调整后,与对照组相比,HCM不同亚型组间共有差异蛋白57种(图1)。值得注意的是,MYBPC3截断变异的患者样本中,肌球蛋白结合蛋白C减少了40%,其它结合蛋白的差异变化并不显著。如 α-肌球蛋白亚型(MYH6)的丰度降低了96%,但这种亚型在正常心脏中仅占总肌球蛋白的2%。

HCM和对照样品之间的蛋白质丰度存在显著差异,包括与线粒体功能、心脏燃料代谢和能量代谢相关蛋白质的减少。如催化长链脂肪酸β-氧化的关键酶:长链酰基辅酶A脱氢酶(ACADVL)和羟酰基辅酶A脱氢酶(HADHA),以及电子传递酶、黄素蛋白脱氢酶(ETFDH)。此外,参与能量转导的肌酸激酶M型减少了43%,均反映了肥厚型心肌病存在ATP生成受损的潜在可能性。

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图3)

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图4)

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图5)

图1. HCM和对照组的蛋白质组学结果

02
定量靶向代谢组学揭示了HCM组中脂肪酸衍生物和 ATP显著减少、酮体增加、支链氨基酸增加

为了解蛋白质变化对代谢过程产生的影响,使用靶向定量代谢组学平台进行进一步分析。共鉴定出104种代谢物,其中59种代谢物,至少在1个HCM组中与对照存在显著差异。主成分分析显示出HCM群体之间聚类的相似性,且均与对照组显著区分开(图2)。

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图6)

 图2. HCM和对照组心脏的代谢组学分析

与对照组相比,HCM组中最显著的差异是线粒体脂肪酸氧化中间产物的统一减少,尤其是长链酰基肉碱,减少了约 70% 至 95%(图2 B和图3)。参与长链脂肪酸氧化的相关酶的表达,如 ACADVL、HADHA 和 ACAA2 ,与几种长链酰基肉碱呈正相关。相反,酮体3-羟基丁酸、乳酸和3种支链氨基酸(BCAAs=亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸)在HCM组中显著升高(图2 B、图3 和图4)。与对照组相比,HCM组中柠檬酸增加,富马酸减少,除此之外,大部分三羧酸循环(TCA循环)中间产物在不同组别间没有显著差异(图2 B)。非支链氨基酸中的天冬氨酸、甲硫氨酸和丝氨酸在HCM组中减少,瓜氨酸在HCM组中增加。

另外,HCM样品中的三核苷酸ATP、CTP和UTP的丰度均显著降低,磷酸肌酸水平对比对照组下降超过90%,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸及其磷酸衍生物,NADP和NADPH也显著减少,而它们的前体物烟酰胺和烟酰胺单核苷酸(NMN)增加(图2 B和图3)。此外,提供乙酰基团给柠檬酸循环进行氧化以产生ATP的中心分子乙酰辅酶a,也显著减少。综上结果,共同揭示了能量代谢改变在肥厚型心肌病发病机制中的重要作用。

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图7)

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图8)

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图9)

图3. HCM和对照组心脏中代谢物含量变化

03
心肌组织中以ATP为依赖性的交联桥解离

为了确定 HCM 和对照组样本之间 ATP 含量的差异是否会影响心脏力学特性,研究以ATP浓度为变量,测量了人体心肌中交联桥解离的动力学(图4)。在最大Ca2+ 激活条件(pCa 4.8)下,肌肉长度的快速拉伸(图4 A)会导致张力快速增加。对比HCM和对照组样本中ATP含量的平均值和范围,预计HCM心脏中ATP含量的减少会导致交联桥解离速度相比对照组心脏降低约10%,暗示了ATP含量的差异可能影响心脏的力学特性。

04
ATP 水平与患者舒张功能障碍之间的相关性

左心房大小可以作为舒张功能损害程度的敏感指标,同时也是预后评估的一个标志。研究发现,在每位患者进行心肌切除术前进行的超声心动图检查中,左心房大小与心脏样本中的ATP含量呈现负相关。这暗示了ATP的可用性与整个心脏的舒张功能损害之间存在一定的关系。

文献分享 | 蛋白质组联合代谢组揭示肥厚型心肌病的发病机制(图10)

图4. 不同ATP浓度下肌球蛋白交联桥解离速度



结论


为确定人类HCM代谢重编程的性质和程度,本研究基于接受间隔肌切除术的HCM患者的心脏样本进行了配对定量蛋白质组学和靶向代谢组学分析。蛋白质组学分析结果显示,HCM样本中细胞外基质蛋白和多种Z-disc/中间丝蛋白的丰度增加,许多蛋白在感知生物力学应力、信号传导以及肌原纤维修复和稳定方面发挥着重要作用。通过将蛋白质组学和代谢组学分析相结合,发现与对照样本相比,来自HCM患者心脏样本中的一些心脏蛋白质与代谢变化相关。重要的是,这些缺陷与基因型、年龄或性别无关,HCM中的能量缺陷部分归因于肌节内增加的ATP消耗。以ATP浓度为变量,测量了人体心肌中交联桥解离的动力学,观察到HCM心脏中ATP含量的减少会降低交联桥解离速度,这意味着ATP可用性对心肌功能的直接影响可能导致松弛受损。此外,心脏ATP含量与左心房大小呈负相关,表明ATP含量与舒张功能障碍程度之间存在相关性。

综上所述,与对照组相比,HCM患者组显示出核苷酸含量严重不足,脂肪酸氧化能力显著降低,酮体和支链氨基酸增加。这些结果对未来设计用于治疗HCM的代谢调节剂具有重要的治疗意义。

百趣生物干货分享二维码.jpg


Recommend more
推荐更多

微信

在线
咨询

QQ

点击QQ咨询