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BIOTREE | 第21期代谢组学及数据分析培训班圆满结束

分类:
阿趣动态
发布时间:
2019/07/29 14:11
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代谢组学
 
7月22日上午9:00,60余位来自全国各地的代谢组学研究领域的老师和同学冒着酷暑来到上海阿趣生物科技有限公司(以下简称BIOTREE)参加由BIOTREE与Sartorius Stedim 共同举办的第21期代谢组学及数据分析培训班。
 
本次培训班特别邀请了在代谢组学领域的知名专家:上海交通大学吕海涛老师、江南大学纪剑老师、上海生命科学研究院营养科学研究所陶用珍老师,以及BIOTREE资深技术老师前来授课。他们分别围绕代谢组学发展史及技术介绍、课题设计、代谢流技术、样本采集及预处理、多元变量统计分析等方面进行了全方位的解析。课程内容面面俱到,精彩纷呈,将理论知识、经典案例加以结合,让学员充分地理解和掌握代谢组学科研方面的核心要点、操作流程及注意事项。
 
培训期间,学员们都非常认真地对待这次学习机会,积极地在代谢组学的研究思路、方法及多变量统计的方法等方面进行了深入的探讨。
 
PS. 由于各种原因无法前来参加本次培训的各位老师也不用着急,8月17日我们将在广州第22期培训班上为大家继续带来精彩的课程!
 
最后,让我们一起来回顾一下本次培训班的精彩瞬间吧~
 
开班致辞
 
代谢组学
 
BIOTREE CEO 邓军亮老师代表BIOTREE全体员工对本次莅临参加培训的各位嘉宾和学员表示最热烈的欢迎。
 
今年是自BIOTREE 2012年创办以来步过的第8个年头。在这八年之间, BIOTREE已成长为一个超100人的专业科研团队,并通过开办培训班培养了行业内近1000名的储备人才;同时,BIOTREE已在上海建立了属于自己的开发服务中心和产品研发中心。作为一个有情怀的公司,BIOTREE希望将在科研上做出的成果,最终转化为对社会有用的产品,为社会多贡献一份力量。
 
另外,由BIOTREE独家引进的大数据分析标杆产品SIMCA 16版本已正式上线,增加新技术MOCA (Mulitiblock Orthogonal Component Analysis)可实现多组学数据联合分析。当然由BIOTREE研发的MAPS 1.0系统也已上线且功能已经非常齐全,可以为大家在代谢组学全流程(实验操作、数据解析等)相关需求上提供较为完善的解决方案;与此同时,BIOTREE还和南京扬子科创合作,将一起打造全球顶级的质谱检测中心。
 
创业维艰,BIOTREE一直在路上,非常荣幸能遇到大家,感谢大家这一路上的信任与支持。
望大家在本次培训中:“学有所得,得有所用,用有所成”。
引用乔布斯的一句话:“Stay Hungry(虚怀若谷)Stay Foolish (大智若愚)”。
 
插播一条小广告:
欢迎大家加入BIOTREE;
学完我们所有培训课程的学员可以免试入职哟~
 
言归正传,
让我们一起来看看各个课程的精彩点滴吧!
 
01
代谢组学及多元变量统计分析
(7/22-7/23)
 
01
嘉宾:吕海涛
上海交通大学
系统生物医学研究院研究员 
功能代谢组科学实验室负责人
 
代谢组学
 
主题:代谢组学概述与发展
 
本次课程中,吕海涛老师从代谢物的定义、代谢组学的发展史、代谢组学在生命科学中的应用、研究检测代谢相关物质的器械分类及其检测原理;另外,对靶向、非靶向代谢学的研究方向、仪器、分类等多个方面诠释了代谢组学在如今社会上的发展、应用与贡献。
 
02
嘉宾:刘志鹏
BIOTREE 资深研究员
 
代谢组学
 
主题:代谢物溯源在肠道微生态中的研究应用
 
本次课程中,刘志鹏老师讲述了宏基因组学的定义、肠道微生物代谢及其发展趋势和取得的成就。重点介绍了肠道微生物通过产生相应代谢物后发挥的作用,并以案例分享的方式对研究肠道微生物代谢物的方法与思路进行了诠释。
 
03
嘉宾:陶用珍
中科院上海营养所副研究员
主题:代谢流技术的简介及应用
 
代谢组学
 
本次课程中,陶用珍老师主要讲解了三个部分的内容,分别是:代谢流的原理和定义;样品制备方法以及如何设计特殊的标记物监测胞内外代谢流量的变化;C13 和 N15 代谢流分析在人类重大疾病中的应用及相关例证。
 
04
嘉宾:袁晓芳
BIOTREE 技术支持主管
 
代谢组学
 
主题:代谢组学样本收集与前处理方法
 
本次课程中,袁晓芳老师主要介绍了代谢组学研究中的样本收集与处理方法。从不同的样本类型入手,深入且细致地介绍:样本分类、常见的收集方法和遇到的问题、样本收集过程中的通用原则、样本储存及寄送注意事项。同时列举了样本收集处理寄送的实例为大家提供更加明确且真实的操作讲解。
 
05
嘉宾:吴洪强
BIOTREE CTO
 
代谢组学
 
主题:
01_MAPS-代谢组学分析平台构建全流程解决方案: 
 
吴洪强老师详细介绍了MAPS系统的构架原理:从样本到数据采集、到数据库、生信分析全流程覆盖。随后由杜杰老师为大家演示了数据处理、统计分析、功能分析等相关操作及注意事项。
 
02_非靶标、靶标、高通量靶标、及广泛靶标技术简介:
 
吴洪强老师为大家深入介绍了多种代谢组学技术的详解与对比(包括非靶标、靶标、高通量靶标、广泛靶标)从硬件的色谱-质谱联用仪,物质偏好(气态、液态或重叠)到各个代谢组学的研究技术的详细方法、难点、应用方向都一一进行了阐述与举例。
 
06
嘉宾:纪剑
江南大学副研究员
 
代谢组学
 
主题:GC-MS代谢组学下机数据分析
 
本次课程中,纪剑老师就GC-MS代谢组学的下机数据分析流程进行了详尽的数据实操讲解,其包括:CG-MS原始数据、数据类型及格式转换、噪音及基线矫正、提峰与解卷积、锋对齐、空值填补、及物质定性等。每个流程中都例举了相应的优化数据的方法与实例。
 
07
嘉宾:杜杰
BIOTREE 生物信息经理
 
代谢组学
 
主题:多元变量统计分析
 
本次课程中,杜杰老师就大数据与多元变量统计的重要性进行了详细的解读与阐述。对大数据的定义及3大特点、SIMCA系统的演化更新、代谢组学数据分析流程进行了详尽的实例分析与答疑。最后与参加培训的老师与学员们进行了SIMCA软件的实际操作流程演练,使学员们初步掌握了SIMCA软件的运用。
 
02
DOE Course 实验设计课程
(7/22-7/23)
 
嘉宾:David Wang
Sartorius Stedim Data Analytics AB
Senior Application Specialist
 
代谢组学
 
简介:
Wang就任于新加坡Sartorius Stedim Data Analytics AB公司,作为资深应用专家主要致力于SIMCA/MODDE等相关软件等技术应用及支持,其工作重点是数据驱动的工艺建模、工艺监控、工艺控制、实验设计、数据分析、OMICS、PAT和QbD。撰写过60多份期刊论文和会议出版物,并在第四届IEEE工业信息学国际会议上荣获最佳论文奖。
 
代谢组学
 
主题:DOE 课程
 
本次为期2天的DOE(实验设计)培训中, David主讲内容有:DOE在科学领域的应用和DOE中的数据分析步骤;全因子设计思路流程;同时针对以下:Bioassay Optimization(生物测定优化)、Desirability Function(合意性/期望函数)、D-optimal Design(D-最优设计)、GSD in Multivariate Calibration (多元校正中的广义子集设计)、Mixture Design(混料实验设计)、Stability Testing(稳定性测试)、Theory Fractional Factorial Design(部分要因实验设计理论)等多种设计类型及理论化流程分析,提供了相应的课程练习与实例分析,运用点到面的教学方式让参加培训的各位学员由浅到深地了解了实验设计的原理、流程和相关思路。
 
03
GC/LC 原始数据预处理实操
(7/24)
 
嘉宾:纪剑
江南大学副研究员
 
代谢组学
 
主题:GC/LC 原始数据预处理实操分析
 
纪剑老师着重讲解了在非靶标代谢物测试上运用GC-MS/LC-MS的原因,运用思路。并对相应软件MS DIAL做了非常细致周全的介绍及不同供应商的LC-MS数据转换;同时还为大家介绍了物质鉴定的方法及难点、Mona数据库的使用、msp数据库的使用。为了让大家更加深刻地理解本次课程的要领,纪剑老师和学员们一起演练了相关的实战练习:Unknown物质鉴定中的分子式确定和结构式确定方法及流程。
 
04
可视化作图代谢通路网络构建分析
(7/25-7/26)
 
01
嘉宾:纪剑
江南大学副研究员
 
代谢组学
 
主题:代谢通路网络构建分析
 
纪剑老师详细介绍了相关软件Cytoscape等的功能及运用细节,并对两个软件在代谢通路分析上的运用做了全面的演示和实战练习。纪剑老师和学员们进行了大量的实际操作训练,以加强大家对相关知识内容的熟悉度。
 
02
嘉宾:杜杰
BIOTREE 生物信息经理
 
代谢组学
 
主题:可视化作图
 
杜杰老师综合叙述了层次聚类法,带领大家学习了层次聚类法热力图-MEV软件的学习及应用,并做了相关的案例演练。接着进行了对代谢通路分析中运用到的MetaboAnalyst网站、ROC曲线、箱式图案例等进行了更为全面的讲解。最后向大家介绍了KEGG网站并演练相关的案例分析。
 
05
MVDA for Research
(数据实操课程)
(7/27-7/28)
 
嘉宾:杜杰
BIOTREE 生物信息经理
 
代谢组学
 
主题:MVDA for Research
 
本次主题为SIMCA进阶实操课程,杜杰老师主要的课程涵盖内容包括:PCA/OPLS-DA/PCA-Class、O2PLS与解读、潜在小分子生物标记物发现、多组学关联模型分析。
 
结语
 
大家仔细地聆听,认真地记录,积极地讨论,怀着一个空杯的心态和BIOTREE一同度过了一周的学习时光。相信大家在这样一个干货满满的培训课程中,定是学有所得,望大家在之后的学习研究中可以得有所用,用有所成。
 
感谢各位嘉宾老师的莅临与悉心讲解;再次感谢各位学员的到来;希望有机会再和大家一起交流学习。
 
精彩仍会继续,我们8月17日广州第22期培训班再见!!!
 
代谢组学
 
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BIOTREE | 第21期代谢组学及数据分析培训班圆满结束