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土壤代谢组学

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土壤代谢组学(soilomics)是指用代谢组学的方法研究土壤中有机质及土壤微生物代谢含量变化及相互作用的一门科学。土壤微生物是土壤不可缺少的组成部分,是陆地生态系统中的分解者和调节者,能够参与生态系统的物质循环以及能量流动,其分布及活性揭示土壤的变化规律和演变趋势。研究土壤微生物碳代谢功能特征可以了解微生物多样性及其碳代谢能力,为探索调节、控制和改善土壤环境质量提供重要的参考。

 

技术优势

前处理经验丰富:能充分提取出土壤中的代谢物;
检测种类多:可检测土壤中多类代谢物。
 
技术路线
 

技术参数

样本要求
土壤样本      1-10 g/sampl
 
生物学重复
不低于6个生物学重复
 
检测平台
GC-TOF-MS(Agilent 7890B-LECO Peagsus HT/BT)
 
常规项目周期
实验检测:20个工作日(从收到客户预付款并收到样品之日起)
数据分析:5个工作日
 
应用方向
1、土壤有机质及微生物成分分析;
2、土壤微生物代谢通路研究;
3、土壤生物多样性及功能;
4、污水土地处理系统代谢机制研究。
 
案例分析
      利用定量代谢组分析土壤代谢鉴定土壤基质
体外代谢组可以分析土壤细菌产生的低分子量有机物质的组成。本研究从腐殖质土壤中收集水溶性土壤微生物代谢物建立一种用非目标特征鉴定土壤基质的方法。用液相色谱质谱(LC/MS)和气相色谱质谱(GC/MS)鉴定到96种代谢物,代谢物定量信息可用于鉴别两种土壤基质(SDM)。这种方法也可以应用于鉴别不同特征的微生物群落。
 
参考文献
Jenkins S, Swenson T L, Lau R, et al. Construction of Viable Soil Defined Media Using Quantitative Metabolomics Analysis of Soil Metabolites[J]. Frontiers in Microbiology, 2017,8.
 
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