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蛋白质组学

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蛋白质组学是以蛋白质为研究对象,通过质谱技术对生物样本中的蛋白质进行检测和分析,研究其组成及变化规律的科学,通过对蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等的研究,获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

 

技术优势

技术成熟稳定、分辨率高、选择性好;
可多样本同时检测,分离效果好;
定量准确性较高,实验周期短;
专业的数据处理分析团队。
 
技术路线
 

技术参数

样本要求
动物组织       0.2-2 g/sample
细胞体系       1×107 cells/sample
植物           1 g/sample
菌体           100-300 μL/sample
细胞培养上清液 50-100 mL/sample
血清、血浆     150 μL/sample
尿液           5 mL/sample
如上述未提及的样本,可咨询销售工程师
 
检测平台
Q-Exactive或Orbitrap Fusion Tribrid MS
 
常规项目周期
实验检测:35个工作日(从收到客户预付款并收到样品之日起)
数据分析:10个工作日
 
应用方向
1、蛋白的鉴定;
2、蛋白功能的研究;
3、信号通路的研究;
4、疾病标志物的发现;
5、药物作用靶点的发现。
 
案例分析
肝细胞癌生物标志物的发现
肝细胞癌(HCC)是肝脏的原发性恶性肿瘤。在临床诊断上有一定的难度,尤其对于甲胎蛋白阴性的患者,因此需要新的生物标志物用于HCC筛查。由于血液中蛋白成分复杂,低丰度蛋白难鉴定等原因,组织间质液(TIF)作为组织细胞周围的近端液体,可以反映肿瘤发展过程中的微环境变化,且含有较少的高丰富蛋白,所以是发现肝细胞癌生物标志物合适的样本来源。本文通过对TIF的蛋白质组的深入分析发现了新的HCC候选生物标志蛋白SPARC和THBS2,进一步检测血清中这两种蛋白的实验和分析结果表明SPARC和THBS2可以正确区分正常人与HCC患者,同时也证实了TIF在发现肝细胞癌蛋白质生物标志物的实用性。
 
参考文献
[1] Zhang J, Hao N, Liu W, et al. In-depth proteomic analysis of tissue interstitial fluid for hepatocellular carcinoma serum biomarker discovery.[J]. Br J Cancer, 2017, 117(11).
[2] Fountain J C, Jin K, Yang L, et al. Proteome analysis of Aspergillus flavus isolate-specific responses to oxidative stress in relationship to aflatoxin production capability[J]. Scientific Reports, 2018, 8(1).
 
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